机械大帝离开前，依照着承诺与对造物主的情分，留下了足够的设备与大量现成的资源，用以维持虚拟世界的存在，以及建设类似锡安的现实人类城市。
但这些设施也需要一个强大的智能程序的控制才能正常运作，如果没有智能程序的辅助，人类终将在无知无觉中死去，更别提逐步觉醒回归现实了。
机械大帝已经带着所有他控制下的智能程序离开了，但人类也不用担心自己会灭绝——
尼奥留了下来。
知晓了自己智能程序的身份，知晓了自己经历的一切都是被安排好的，尼奥也没有产生逆反的心绪。
对人类的爱驱使着他作出决定——成为维护虚拟世界的管理者，成为人类觉醒的引导者，在这遍布金属的星球上，探寻人类生存与发展的道路。
这不是一条简单的道路，沉浸在虚拟幸福中的人类，要如何直视残酷的现实呢？作为智能程序的尼奥，要怎么定位自己，和人类协调走上正确的道路呢？
带着这些疑问与淡淡的惆怅，程斌隐身游览了一圈正在建设的新锡安。
大量作为工人的机械章鱼与少量的原锡安人员合作忙碌着。
看着经过身体调整后，在各种装备保护下艰难适应着现实环境的人类，看着他们在迷茫与坚定间变幻的神情，程斌叹了口气，启动了回归程序，他那不可见的身影瞬间从这个世界消失。
......
內域零号世界，荧惑基地。
“大丰收啊...”程斌瘫在沙发上，双目无神地看着天花板，垂在侧面的手指下意识地比划着，“人类感知与控制模拟技术、人类记忆控制技术、高级智能程序技术、引力探测技术、虚拟现实构筑技术、电磁勾连与无线输能技术...”
一项一项数着在黑客帝国世界里的主要收获，程斌看着面板里那密密麻麻的技术目录，一时间感到脑仁发疼。
“好东西太多了，都不知道从何着手...”程斌摇着头叹了口气，“这真是幸福的烦恼啊...”
可以预见的是，程斌所在的火星基地将迎来一次翻天覆地的大建设大改造，所以程斌回归后都没有第一时间去荧惑基地各个区域进行检查调试。
“仔细想想，我去那个世界的主要目的就是感知与记忆的解析控制吧，”程斌摩挲着下巴思考了一会儿，最后下定了决心，“先完成这个项目比较好，完成后，直接将知识记在脑子里比起从面板间接查阅要方便的多，研究其他项目的进度也会加快吧。”
感知输入与控制信号输出，这两项程斌基本已经掌握了，但记忆控制...
程斌看着面板上筛选出的，和记忆操纵有关的技术知识皱起了眉头。
黑客帝国世界的智能程序，是靠着数以亿计的沉浸在虚拟世界里的人类作为研究与实验对象，才能对比解析出人脑记忆运作的规律，探明所有的基础信息元，搞出记忆操纵这种技术来。
即便如此，黑客帝国里对记忆的操纵也有一定的限制——
智能程序已经探明的基础信息元，基本都是人类依照着基因发育出的共通单位，不同人的基础信息元几乎完全一致，但在基础信息元的基础上，每个人类形成的高级概念并不一定拥有相同的物质结构，所以智能程序很少进行太复杂的记忆植入，也难得直接影响人类的思维。